Author Archives: philippe eveillard

L’anti-manuel de PubMed valorise l’affiliation descripteur/qualificatif

Sur chaque référence indexée est accrochée une étiquette Sur cette étiquette sont listés les termes caractérisant le contenu de l’article. Cette étiquette, c’est l’index. Les termes de l’index appartiennent à un thesaurus, un vocabulaire dans lequel les termes (ou descripteurs) ont, entre eux, des relations hiérarchiques. C’est le langage de PubMed. Un descripteur peut se […]

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L’anti-manuel de PubMed est sur Amazon

L’anti-manuel, le retour Il y a un an, l’anti-manuel de PubMed était au programme du blog sous la forme de 4 billets d’anthologie. Aujourd’hui, j’en rajoute une couche. C’est une couche plus épaisse (88 pages), en ligne sur Amazon et téléchargeable en échange d’une place de cinéma, d’un paquet de gauloises ou d’un café au […]

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Ce que révèle l’interrogation de PubMed sur le dopage de Maria S.

Ergogénique en théorie, sans efficacité réelle probablement, mais certainement placée sans raison valable sur la liste des produits dopants. Tel peut être caractérisé le meldonium après être passé dans la « moulinette » de PubMed et de la littérature médicale récente. L’histoire A l’Open d’Australie (janvier 2016), la joueuse de tennis russe Maria Sharapova est contrôlée positive […]

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L’interrogation de PubMed n’est pas uberisable

Le 3 janvier 2016, Philippe Ameline a tweeté : « Tss, tss, je pense que vous serez étonné du nombre de non-médecins plus à l’aise avec PubMed que les praticiens ». Plus à l’aise ? Pourquoi pas. Plus performant ? J’en doute. Explication L’interrogation de PubMed se déroule en 4 étapes : – choix des mots clés […]

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Fuyez les « pass navigo » de PubMed

Les tutoriels qui fournissent des indications sur la façon de naviguer dans PubMed peuvent être assimilés aux « pass navigo » qui donnent accès au métro (et à la circulation dans ses couloirs…). Ces tutoriels indiquent vers quoi diriger le pointeur de votre souris et comment cheminer dans l’interface. Mais, cela ne sert à rien de cheminer […]

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On ne plante pas un clou avec une clé de 8

Vous vous retrouvez au petit matin devant les résultats PubMed de votre recherche « sodomie et mycose vaginale » (Jaddo  Petit traité imaginaire de médecine réelle 2 juin 2015) Merci à Jaddo d’avoir fait allusion à PubMed en ces termes dans son dernier billet. Cela me donne l’occasion de revenir sur l’aberration qui consiste à entrer 2 […]

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L’anti-manuel (suite et fin)

My NCBI a oublié de prévenir ses « fidèles » qu’une équation de veille ne se formulait pas comme une équation de recherche. Un oubli qui montre à quel point ce service mérite d’être… oublié. Comprendre Dans PubMed, certains articles sont indexés et d’autres (moins nombreux) ne le sont pas. Les articles indexés constituent la banque de […]

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L’anti-manuel (4)

Il n’y a qu’une seule bonne façon de formuler la première équation, mais il faudra toujours la reformuler*. C’est écrit nulle part, mais ça tombe sous le sens. Une seule bonne façon… Pour formuler la première équation selon le langage et la grammaire de PubMed, il n’y a pas 36 façons de faire. Aucun mot-clé […]

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L’anti-manuel (3)

Vanter les performances de PubMed dans la recherche d’une solution à un problème clinique est manifestement outrancier. Pourtant, certains ne se sont pas privés de le faire. En France, c’est là (texte et vidéo)* ; aux Etats-Unis, c’est là. Rappel : la vocation première d’une banque de données bibliographiques est de référencer un article scientifique ou une […]

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L’anti-manuel (2)

« PubMed n’est pas Google ». La National Library of Médicine (NLM) souhaite vous persuader du contraire. Grâce à l’Automatic Term Mapping* (ATM), vous pouvez interroger PubMed sans rien connaître du langage (hermétique) ni de la grammaire (originale) de l’outil de recherche. L’ATM interprète votre requête (en général formulée à la Google) d’une façon déplorable et bruyante. Déplorable car […]

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